Misskey本家、あるいはフォークが、Mastodon式のアカウントのIndexableをサポートすれば、そちらが優先されるようになるよ。
Fedibird方式の許可設定もあるけど、現実的にはMastodonの方式をサポートした方がいいんじゃないかな。
Mastodonは全文検索のオプション指定がかなり豊富にあるんだけど、Fedibirdはそれをもっと拡張して、可能な限りできることを増やしてあるから、活用してね。
自分の投稿は from:me
別の人やサブアカなら from:noellabo@misskey.io
相手指定なら to:noellabo@mstdn.jp
ブーストした人なら by:noellabo@dtp-mstdn.jp
ドメイン絞るなら domain:nijimiss.moe
とか。
詳細はこちら
https://blog.noellabo.jp/entry/fedibird-advanced-search
もしFedibird式の検索ポリシーに対応してくれるなら、投稿毎に(Note Objectに)searchableByがついてるので、ここで判断してくれれば助かるよ。