私は古いほうのアニメや原作をちょっと見ていただけなのでこれは与太ですが：私は2作の共通点は「血縁ファミリーに縛られない」ではと思います。
トライガンは恋愛要素がなく、むしろウルフウッドと孤児院、元奴隷でナイブズに拾われたレガート、双子をこっそり慈しんだレムなど、非・血縁の家族関係が命を賭けるほどかけがえのないものとして繰り返し描かれる。
『こうしてあなたたちは時間戦争に負ける』は、対立し逃走し続ける組織に所属する女性2人が文通しつつ心を通わせ、生まれそだった組織より後天的に知り合った相手を選ぶ話。

旧アニメ版では、原作にはない男女恋愛があるというご指摘が。<RT

これは、ネビュラ賞受賞&ヒューゴー賞、世界幻想文学大賞候補者のSFF作家ジョン・ウィズウェルが、トライガンファンダムが発端でなぜか本が売れた話を聞き、旧アニメDVDで“祈願”している様子です。
https://twitter.com/Wiswell/status/1656370854656110601?t=PnS3SL2k3mEXJJGIjRZ6RA&s=19

ちなみにジョン・ウィズウェルの日本語訳が、近々刊行される『Babelzine vol.3』（バベルうお）に掲載されるらしいですよ。