JN.1: The Odd Man Out Among Omicron Sublineages
These data again emphasize that high ACE2 binding affinities, such as FLip (455F+456L) variants and BA.2.86, would allow fast collections of mutations that can further boost immune evasion. 3/3
L455S mainly escapes Class 1 neutralizing antibodies, which made up for the weakness of BA.2.86 (vulnerable to Class 1 Abs). Of note, FLip + A475V could evade almost all of Class 1 Abs, which explains why we have seen so many A475V mutations on FLip variants recently. 2/3
Cao博士↓
Updates on several concerning variants, JN.1 (BA.2.86+L455S), JD.1.1(FLip+A475V), HV.1(EG.5+L452R).
1) L455S on BA.2.86 (JN.1) greatly increases antibody evasion at the cost of ACE2 binding.
2) HV.1 and JD.1.1 are more evasive than FLip but display lower ACE2 binding as well. 1/3
日本医師会は6日、院内処方をしている医療機関の9割が医薬品の入手が困難な状況にあるとの調査結果を発表した。宮川政昭常任理事は記者会見で「適切な備蓄確保や感染症流行時の生産拡大など、さまざまな方策が必要だ」と訴え
https://news.yahoo.co.jp/articles/64f25f43df1184e199a4c9e7ee4902fc119ae026
日本の最新変異株イメージ。
EG.5.*「Eris」亜種（39％）が8月中旬から優勢。
BA.2.86.1 "Pirola "の成長率に関する初期の読みでは、EG.5.*に対して1日あたり14%の成長率で優位に立っており、これはクロスオーバーが近いことを予測している。
サンプルの数量は9月15日までの代表的なものと思われる。
ダッシュボードには、主要変異スパイク、L455S, ORF1a:R3821K, ORF7b:F19Lを持ったJN.1 (BA.2.86.1.1) が含まれている。
Spike L455S はより免疫回避能力を上げる。
Great work as usual by @BenjMurrell highlighting as JG.3 HK.3.2 BA.2.86.1 seems to have
A solid advantage (>50%) over EG.5.1.1 and confirming the signal we are getting everyday stronger.
At least local waves are granted by these lineages
(Gueli)
メモ📝
※ウィルス量のピークは発症日から上昇してピークは4、5日目。
※RATの感度:
発症1日目30-60%
4日目で80-93.3%
Delayed Peak SARS-CoV-2 Viral Loads Relative to Symptom
https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciad582/7285011?login=false
2023年 7月 に登録
