MastodonやMisskeyは、ブラウザからアクセスするWebUIでフル機能を実装しています。
スマートフォンからのアクセスについても同様で、ブラウザからアクセスし、ホームに保存してアプリのように使うPWAが基本となります。
アプリを使う場合でも、WebUIは利用できるようにしておくことをお勧めします。
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アプリのメリットとしては、
一つのアプリで複数のサーバを利用でき、
仕様が異なるサーバでも同一の利用体験が得られること、
サーバを跨いだ操作ができること、
ログイン状態の維持がしやすいこと、
作り込みにより軽快な動作が期待できること、
プッシュ通知を受け取れること、
WebUIには存在しない便利なアプリによる追加機能が使えるものもあること、
などが挙げられます。
なお、WebUIでアクセスできない状況が生じた際(サーバ側の不具合や、IDやパスワード忘れ)にも、アプリでログインしておくことで、そこからのアクセスで救われることがあります。
特にMisskeyはメール登録が必須で無いケースが多く、一度アクセスできなくなると本人確認する術が無くなるので、重要な保険になるかと思います。
WebUIとアプリ(なんでも良いので一つ)、それぞれ普段からログインしておくと安心です。