Mastodonのschedulerキューを分離する仕組みにしたのは私です。（issueを解決）
https://github.com/mastodon/mastodon/pull/15314

schedulerは、複数のプロセスで実行しないでください。

複数プロセスで実行すると、スケジュール実行するタスクが重複実行されて具合が悪いため、それを回避するための仕組みです。

sidekiqの設定は、systemdのunitファイル（mastodon-sidekiq.service）に記述します。

単一プロセスなら

ExecStart=/home/mastodon/.rbenv/shims/bundle exec sidekiq -c 25

という記述（デフォルト）でOKです。

2つ以上のプロセスにする場合は、それぞれにキューを明示します。

ExecStart=/home/mastodon/.rbenv/shims/bundle exec sidekiq -c 25 -q default,8 -q push,6 -q ingress,4 -q mailers,2 -q pull -q scheduler

最後の -q scheduler は、複数プロセスのうち、どれか一つにだけつけます。