@shigurechan たとえばWebサービスがMastodonに連携するような形でクライアントとしてアクセスするなら、自分のサービス側の特定のアドレスをコールしてもらえばいいわけです。
redirect_uri=http:/ /myservice.example.com/oauth2/mastodon/callback
ユーザーが連携にOKすると、http:/ /myservice.example.com/oauth2/mastodon/callback?code=xxxxxxxx って呼び出しがくる形です。
アプリの場合は、たとえば内蔵ブラウザから呼び出して、リダイレクトされたときにアプリを呼び出すURLを指定します。たとえば subwaytooter://oauth/ というような。