リプライとして投稿した内容は、通常の投稿と同じようにフォロワーに向けて転送されるワケですが、Mastodonの場合、
リプライ先の投稿者とリプライを行った投稿者の両方をフォローしていない場合、ホームタイムラインに表示されません。
Pleromaやちょっと前までのMisskeyでは普通に表示されます。Mastodonにならって、表示しない方向に向かっています。
なお、Mastodonでもアカウントの「投稿と返信」欄には表示されますので、みられないわけではありません。みませんが。
個人的なメッセージや受け答えは表示されなくてもいいのですが、通常の投稿と同じように、見えるように投稿したい場合には、自分でブーストするしかない状況です。
また、ローカルや連合にはリプライが表示されない上に、ブーストも表示されません。
これにより、本来リプライが適切な場合でも、通常の投稿を行い、良くて相手にメンションを、通常は何も関連を示さずにエアリプすることが促されています。
これは、エアリプやスレッドを生成しない単体メンションをする人に善し悪しを言っても仕方のないことで、システムの設計の問題です。