今回の件、直接的な問題はjson-id-preloadedというgemにあります。Eugenさんが出した修正PRです。
https://github.com/ruby-rdf/json-ld-preloaded/pull/5
Mastodon v2.9.2、v2.9.3ではこの問題は起きません。
Mastodon側としては、masterの7月28日のこのコミットでjson-id-preloadedのバージョンを引き上げた際に発生するようになりました。
Bump json-ld-preloaded from 3.0.2 to 3.0.3
https://github.com/tootsuite/mastodon/pull/11316
ついては、v3.0.0のサーバは要注意です。たぶんキャッシュが1ヶ月ぐらいは効いているので、rails cacheをクリアしなければv3.0.1が間に合うんじゃないかな……(しらんけど) #mastodon