キリスト教に限らずだとは思うけれど、宗教が男性優位的な社会(を描いていると思われる)のは宗教自体の仕組みがそうだからという訳ではなくて、そういう宗教が成立した時期の時代的制約のようなものの影響だと思います。
当時はそういう社会だった、そういう価値が一般的だったという事から宗教にもそういう影響が滲み出てしまっていたのではというのが自分の考えです。
現代においては宗教は恐らく社会の歩みに合わせる形を取る事によってそのような男性優位的な価値観から脱却していくのだと思いますが、ただそれは各宗教がどの程度社会の価値観の変化と連動しているかにもよるのだと思います。