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東京の変異株推移(6/20-6/30)
Lineage frequency も一緒に出してみました。二枚に分かれてしまい、重なる部分もあるので見にくいかも↓
XBB.1.16*系統の頻度が減らないですね🙄
1.9*も気になるけど、2.3*系統が何気にずるずる頻度が上がっているのもなんだかね。

Raj博士の30days trendsから、日本のデータを抽出。6/8〜

首位　XBB.1.16 47件
二位　FL.4 23件
三位　XBB.1.16.1 18件
↓表をご参照ください。

(期間後半の方はシーケンス数が充分ではないので必要以上に大きく見えている株がある可能性もありそうですが🤔)

Raj博士の30days trendsから、日本のデータを抽出。6/8〜

首位　XBB.1.16 47件
二位　FL.4 23件
三位　XBB.1.16.1 18件
↓表をご参照ください。
(後半、シーケンス数が足りず、必要以上に大きく見えている株もある可能性はあるかもしれません)

6/26に、沖縄の5月の入域観光客概数が発表されている。海外の分はまだ出ていないので、国内分だけ。東京からが48.4%。人数にして267,100人。

沖縄、出席停止人数1123人。一万人あたり56.00

千葉、出席停止人数1006人。一万人あたり17.82

7/4-5登録分を入れて全体を見てみると、
6/1からで、東京の変異株推移はこんな感じ。後半部分はシーケンス数がより少ないので、6/15辺り以降の跳ね上がりは判断基準にならないと思いますが。

7/4,7/5登録で、主に東京からシーケンス登録がありました。あまりにバックデートした分は入れておりませんが、検体採取日付の新しい方からの東京の77件のデータです。
結構バラバラしてますよね🤔

東京の変異株推移(6/1-)

6/29-7/3に、かなりのシーケンス登録が過去に遡って地方からありましたので(千葉県など検体採取日3/13から登録あります)、5/1以降でEG.5.1をCov Spectrumで出してみました。件数は51件。