2000系も9000系も、直通前から地上運用に投入されてますからね。
2000系はかなり直通専用に近い設計思想ですが、登場当時は4連、なおかつ地上運用にも20m級でない車が多数あったという状況。
それが需要増によって増結されていったわけですが、よって自然と直通専用車にシフトできたフシはあったような。