リプライに #fedibird タグつけるのは私もちょこちょこやってますが、質問への回答とか一般性のある活用方法のような、みんなに見てもらった方が良さそうなものを選んでます。

Mastodonはリプライを無関係な人（会話の当事者双方をフォローしていない人）に表示しないよう工夫していることもありますので、活用していきましょう。

一般に、個人への返信、特定の話題の深掘りは、リプライが適しています。

ある話題をきっかけに参照しながら、それに従属しない投稿を行う場合は『参照』や『引用』が適しています。

どちらとも言えない・どちらにも該当する場合の判断が難しい。

ハッシュタグはそれをフラットに扱えるので便利ですよね。