@Methylenedi_oxy 相互限定やサークルはメンションなしでリプライされるので、通知されません。他の公開範囲についても、投稿本文中にメンションがない場合、通知されないのが正常動作です。
(WebUI上で通知の分類が返信となっているのは厳密には誤りです。これはメンションに対する通知です)
なお、DMやフォロワー限定、相互限定については、メッセージ部分だけでなく、やりとりをしていること自体を一律に伏せた方がよろしいかと思います。
様々な目的に使える、日本の汎用マストドンサーバーです。安定した利用環境と、多数の独自機能を提供しています。