クエリー回数に応じて差が発生していることから結局のところ通信プロトコルの差なんじゃないかと思うな。ローカルで試してるとのことだがローカルでもRedisとTCPで通信しているならそりゃSQLiteの方が早いでしょうよ
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Rearchitecting: Redis to SQLite | Wafris
https://wafris.org/blog/rearchitecting-for-sqlite
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