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すみません、盛大に勘違いしておりました……。見かけの公開範囲が公開なので未収載処理されているとは思っていませんでした。
記憶違いもあったようで、大変失礼しました。
@noellabo んん？
サイレンスされてるアカウントのトゥートを確認したのですが、公開範囲アイコンは公開のままに見えておりました。
@kuroCat わたしもきちんと確認していたわけではなくコメントしていっただけなので，詳しくないです（間違っているかも）。ただ，上手く処理されていないのはそうなので，解決されると良いなは思っています。おつかれさまです。ユーザー側の問題ではない場合，投稿のURLをきちんと伝えて，管理側に確認してもらったほうが良いのかなとは思いますが。
@k_taka 識者の方と話しておりました。
要点としましては、
a. サンセンスされたユーザーの投稿を強制的に未収載に仕様はv3.1.3から
b. それよりバージョンの古いインスタンスでは、サイレンスされたユーザーでも公開投稿できていた(LTLに流れないだけだった)
c. jpにおいては12/18の0時〜5時のメンテナンス時にv3.2.2にアップデートされたため、このタイミングでa.の仕様が適用された可能性がある(「可能性がある」と書いたのは、アップデート前のバージョンが自分にはわからないからです)(アップデート前にすでにv3.1.3より新しかった場合はc.に書かれたことは正しくない)
d.他のインスタンスのHTLにリモートで届いた投稿は、元の公開範囲が維持されている(ように見える？)
e.公開タイムライン（連合、ローカル、ハッシュタグなど）では投稿時の公開範囲によらず、サイレンスされたユーザーの投稿は表示されない(つまり、未収載扱いとなる)
ということのようです。
@kuroCat 公開範囲のアイコンがつくようになっているので、サイレンスされた人自身も、自分の投稿が勝手に未収載になっちゃうことに気づけるようになっています。