レイヤーの多い/少ないが良い/悪いということは無くて、
1️⃣ 後から部分的に直したくなったとき便利になるように分けてあって
2️⃣ 自分がわかるように整理できてる
なら何でもOKだと思ってます。少なくとも趣味絵においては。