艦娘がそのルーツにまつわるアイコン（印章、動植物、名産など）を身に着けたり、掲示したりする例は公式にもあるけど、国旗については政治的中立性への配慮か、旗自体を出すのは避けてる印象がある。旗の要素が混ざった艦娘はいるけど。
例：ゴトランド、サウスダコタ（立ち絵の旗は星条旗とは違う）
艦これのメディアミックスの中でも「史実」色が強いいつ海（アニメ2期）でさえ、日の丸や星条旗の描写は避けていた。
現実の戦争がモチーフとはいえ、艦娘は特定の国家ではなく、あくまでも深海棲艦（人類共通の脅威、制御不能な破壊）から人々を守る存在だということを描きたかったのかもしれない。
家具アイテムの「天霧と大統領の窓」は、 #艦これ では珍しく日の丸と星条旗をそのまま描いてる。後の米国大統領ジョン・F・ケネディの乗る魚雷艇と駆逐艦天霧が衝突したエピソードに由来する。
一国の長との縁や、敵味方の恩讐を越えた親善を表現する必然性があり、例外的に国旗を描写したのだと思う。
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艦これのメディアミックスの中でも「史実」色が強いいつ海（アニメ2期）でさえ、日の丸や星条旗の描写は避けていた。
現実の戦争がモチーフとはいえ、艦娘は特定の国家ではなく、あくまでも深海棲艦（人類共通の脅威、制御不能な破壊）から人々を守る存在だということを描きたかったのかもしれない。