ただここ数年でマイナンバーでかなり簡略化はできたと思う、事業主レベルじゃなければそこまで困らないはず…
不安なことや不明なことは税務署に聞けば数十万単位までなら対応できるし、それ以上なら税理士さんに任せれば大体なんとかなると思うな