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ええと、Mastodon v3.1.5は恐らく、新しいオーディオプレイヤーなど新機能を外し、重要な変更だけを適用したstable-3.1ブランチで提供されるのではないかと思います。（推測です）
v3.1.5には含まれないかもしれませんが、Elasticsearchによる全文検索を利用している方は、雑なworkaroundにより7.x系に対応を行った副作用で、6.8.1以降のバージョンが必要となっています。もし対象外のバージョンを利用されている場合は対応が必要になるのでご注意ください。
v3.2.0には確実に入ってくると思います。
この件『インデックスがあれば消す』ようにしてたので、問題なくなりました。
https://github.com/tootsuite/mastodon/pull/14259
Mastodon v3.2.0（もう少しあとで出る奴）のハマりポイント、もう一つあげておくと、
PgHeloでduplicate Indexを指摘されていたものを自分で削除している場合、今回はそれを削除するマイグレーションが含まれているので、db:migrateでコケるってこと。