私が認識している日本軍による最初の住民虐殺は戊辰戦争の時の官軍の暴虐だな。

https://apeman.hatenablog.com/entry/20070108/p1
「若松城下、抵抗する会津兵はもとより、武士、町人百姓、老若男女の別なく、町のなかにいた者は見境なく斬られ、打ち殺された。攻める者は血を見ると、怪鬼のように快感を覚えて、人影を見れば撃ちまくった。恐怖で立ちすくむ女児の後ろから阿修羅の刃が 襲った。 」